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 | Acceso al texto completo restringido a Biblioteca INIA Las Brujas. Por información adicional contacte bibliolb@inia.org.uy. |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
26/04/2023 |
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Actualizado : |
19/06/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
REBOLLO, I.; SCHEFFEL, S.; BLANCO, P.H.; MOLINA, F.; MARTÍNEZ, S.; CARRACELAS, G.; AGUILAR, I.; PÉREZ DE VIDA, F.; ROSAS, J.E. |
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Afiliación : |
MARÍA INÉS REBOLLO PANUNCIO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; SHEILA SCHEFFEL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; PEDRO HORACIO BLANCO BARRAL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FEDERICO MOLINA CASELLA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SEBASTIÁN MARTÍNEZ KOPP, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JULIO GONZALO CARRACELAS GARRIDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BLAS PEREZ DE VIDA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JUAN EDUARDO ROSAS CAISSIOLS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Department of Statistics, College of Agriculture, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay. |
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Título : |
Consolidating twenty-three years of historical data from an irrigated subtropical rice breeding program in Uruguay. |
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Fecha de publicación : |
2023 |
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Fuente / Imprenta : |
Crop Science, 2023. https://doi.org/10.1002/csc2.20955 - [Article in Press]. |
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ISSN : |
1435-0653 |
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DOI : |
10.1002/csc2.20955 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: First published 15 March 2023. -- Corresponding author: jrosas@inia.org.uy -- |
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Contenido : |
Breeding programs generate vast amount of data which are often scattered in separate files. This hinders the application of modern breeding tools such as multi-environment analyses and genomic selection. This research work describes the process of consolidating 23 years of phenotypic, pedigree, and genomic records from the Uruguayan national rice (Oryza sativa L.) breeding program, and the features and structure of the resulting database. Using a custom-made R code, we gathered all the available data from 1997 to 2020 corresponding to field trials, blast disease evaluation nurseries, laboratory analyses of milling and cooking quality, pedigree information, and genomic information for selected advanced breeding lines, and organized it into a relational database. Records of 996 trials in 12 locations over a span of 23 years, 91,636 field plots with information on 14 phenotypic variables, pedigree for 19,447 genotypes, and genomic information regarding 61,260 single nucleotide polymorphism (SNP) markers for 965 genotypes were recovered. The dataset is structured in trials, phenotypes, lines, genomic information, and SNP tables in an easy-to-access relational database, which will be a valuable resource for rice breeding. © 2023 American Society of Agronomy, Crop Science Society of America, and Soil Science Society of America |
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Palabras claves : |
Breeding program; Breeding trials; Phenotypic data. |
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Thesagro : |
ORYZA SATIVA L. |
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Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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Marc : |
LEADER 02322naa a2200301 a 4500
001 1064059
005 2023-06-19
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1435-0653
024 7 $a10.1002/csc2.20955$2DOI
100 1 $aREBOLLO, I.
245 $aConsolidating twenty-three years of historical data from an irrigated subtropical rice breeding program in Uruguay.$h[electronic resource]
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500 $aArticle history: First published 15 March 2023. -- Corresponding author: jrosas@inia.org.uy --
520 $aBreeding programs generate vast amount of data which are often scattered in separate files. This hinders the application of modern breeding tools such as multi-environment analyses and genomic selection. This research work describes the process of consolidating 23 years of phenotypic, pedigree, and genomic records from the Uruguayan national rice (Oryza sativa L.) breeding program, and the features and structure of the resulting database. Using a custom-made R code, we gathered all the available data from 1997 to 2020 corresponding to field trials, blast disease evaluation nurseries, laboratory analyses of milling and cooking quality, pedigree information, and genomic information for selected advanced breeding lines, and organized it into a relational database. Records of 996 trials in 12 locations over a span of 23 years, 91,636 field plots with information on 14 phenotypic variables, pedigree for 19,447 genotypes, and genomic information regarding 61,260 single nucleotide polymorphism (SNP) markers for 965 genotypes were recovered. The dataset is structured in trials, phenotypes, lines, genomic information, and SNP tables in an easy-to-access relational database, which will be a valuable resource for rice breeding. © 2023 American Society of Agronomy, Crop Science Society of America, and Soil Science Society of America
650 $aORYZA SATIVA L
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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| Registros recuperados : 104 | |
| 41. |  | CASTILLO, A.; CEPPA, M.; DEL PINO, G.; BONILLA, B.; DAVIES, P. Ajuste de un sistema de multiplicación in vitro para la especie aromática nativa: Aloysia chamaedryfolia. [resumen] ln: SUH (Sociedad Uruguaya de Horticultura). Congreso Nacional de Horticultura, 7.; Seminario de Liderazgo Profesional, 1., 1999, Montevideo, Uruguay Resúmenes. Montevideo (Uruguay): SUH, 1999. p. 17| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 46. | | CASTILLO, A.; LOPEZ, V.; TAVARES, E.; SANTIÑAQUE, F.; DALLA RIZZA, M. Polyploid induction of Eucalyptus dunnii Maiden to generate waviability in breeding programs. [Polyploid induction of Eucalyptus dunnii Maiden to generate variability in breeding programs]. Special Issue X Encuentro Latinoamericano y del Caribe de Biotecnología Agropecuaria; XII Simposio REDBIO Argentina. Roca, William, Ed. 12 al 15 de noviembre de 2019, Montevideo, Uruguay. Agrociencia Uruguay 2020, v. 24, no. NE2, Article 381. DOI: 10.31285/AGRO.24.413 9 p. Article history: Received 29 Jun. 2020 // Accepted 28 Sep. 2020 // Published 17 Dec 2020. Comité científico editor: Dra. Marisa López-Bilbao (INTA, Hurlingham, Provincia de Buenos Aires, Argentina); Dra. Sandra Sharry (Universidad...| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : -- - -- |
| Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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| 49. | | CASTILLO, A.; LOPEZ-CARRO, B.; REYNO, R.; RIVAS, C.; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; DALLA RIZZA, M. Manipulación in vitro de la poidía en vegetales. In: JORNADA TÉCNICA, VIII JORNADA DE AGROBIOTECNOLOGÍA. INIA LAS BRUJAS, 30 DE OCTUBRE DE 2014. UNIDAD DE BIOTECNOLOGÍA. Montevideo (Uruguay): INIA, 2014. 10-11 (Actividades de Difusión; 741)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 50. | | CASTILLO, A.; MONTAÑEZ, A.; COSTA, D.; DOCAMPO, R.; CABRERA, D.; RODRIGUEZ, P.; ZOPPOLO, R. Ventajas de la inoculación con micorrizas en plantines micropropagados. Revista INIA Uruguay, 2013, no. 35, p. 54-57. (Revista INIA; 35)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas. |
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| 51. | | CASTILLO, A.; MONTAÑEZ MASSA, A.; DOCAMPO, R.; RODRIGUEZ, P.; CABRERA, D.; ZOPPOLO, R. Micorrización de portainjertos de manzano micropropagados. [Mycorrhization of micropropagated apple rootstocks.] Cultivos Tropicales, 2016, v. 37, Supl. 1, p. 7-12. 1819-4087 NÚMERO ESPECIAL. Este número de la revista está dedicado al X Congreso Internacional de Biotecnología Vegetal (BioVeg2015). Article history: Recibido: 15 de mayo de 2015;
Aceptado: 3 de diciembre de 2015| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : B - 3 |
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| 53. | | CASTILLO, A.; REBUFFO, M.; DALLA RIZZA, M.; FOLLE, G.; SANTIÑAQUE, F.; BORSANI, O.; MONZA, J. Generation and characterization of interspecific hybrids of Lotus uliginosus × Lotus corniculatus. Crop Science, 2012, v. 52, no. 4, p. 1572-1582. Article history: Published July, 2012.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : A - 1 |
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| 54. | | CASTILLO, A.; REBUFFO, M.; DALLA RIZZA, M.; GARCIA, C.; FOLLE, G.; SANTIÑAQUE, F.; BORSANI, O.; MONZA, J. Generación y caracterización de híbridos interespecíficos de L. uliginosus x L. corniculatus ln: Jornada técnica, VI Jornada de agrobiotecnología. INIA Las Brujas, 20 de octubre de 2012 Conocimiento intensivo para el sector productivo: situación actual y perspectivas. Canelones (UY): INIA, 2012. 15-16 (Serie Actividades de Difusión; 698)| Tipo: Actividades de Difusión |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 56. | | CASTILLO, A.; VAIO, M.; LÓPEZ CARRO, B.; DALLA RIZZA, M.; REYNO, R. Estrategia de mejoramiento genético en tréboles de importancia económica para aumentar la persistencia y la tolerancia al estrés abiótico. MV 5 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 283| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 57. | | DISEGNA, E.; MAESO, D.; CASTILLO, A. Proyecto de producción de plantas de frutales de hoja caduca y vid de sanidad controlada. In: SUH (Sociedad Uruguay de Horticultura); COLHOR (Confederación Latinoamericana de Horticultura); Congreso Iberoamericano, 1., Congreso Latinoamericano, 5., Congreso Nacional de Horticultura, 4. Resúmenes. Montevideo (Uruguay): SUH, COLHOR, 1992. p130| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 58. | | DO CANTO, J.; KAVANOVÁ, M.; GARCIA, A.; FRESIA, P.; KASPARY, T. E.; CONDON, F.; CASTILLO, A. Resistencia a glifosato en raigrás anual en Uruguay. ¿La importamos o la generamos en el país? Revista INIA Uruguay, Setiembre 2021, no.66, p. 95-98. (Revista INIA; 66).| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
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| 59. | | ESTEVES, P.; HERNANDEZ, L.; CASTILLO, A.; DALLA RIZZA, M.; QUINCKE, M. Tecnologías para el desarrollo de líneas recombinantes de trigo. MV 20 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 290| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 60. | | ESTEVES, P.; MASTROPIERRO, M.; CASTILLO, A.; HERNANDEZ, L.; RODRIGUEZ, M.; DE LEON, W.; PEREIRA, F.; QUINCKE, M. Herramientas biotecnológicas para el mejoramiento genético de cultivos. Revista INIA Uruguay, 2017, no.48, p. 62-66. (Revista INIA; 48)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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